BioBlender ist ein Softwarepaket, das auf der Open-Source-3D-Modellierungssoftware basiert.Die Biologie arbeitet im Nanomaßstab mit Objekten, die für das menschliche Auge unsichtbar sind.Mit BioBlender ist es möglich, einige der Zeichen, die unsere Zellen bevölkern, basierend auf wissenschaftlichen Daten und dem höchsten Standard der 3D-Manipulation zu zeigen.Wissenschaftler auf der ganzen Welt untersuchen Proteine ​​auf atomarer Ebene und hinterlegen Informationen in der öffentlichen Proteindatenbank, in der jedes Molekül als Liste seiner Atome und ihrer 3D-Koordinaten beschrieben wird. Mit BioBlender können Benutzer Proteine ​​im 3D-Raum handhaben, die ihre Oberfläche fotorealistisch darstellen und anhand bekannter Konformationen Proteinbewegungen ausarbeiten.PDB-Dateien können aus einem benutzerdefinierten Verzeichnis geladen oder direkt von der PDB-Site heruntergeladen werden (durch Einfügen des PDB-Codes).Das Protein wird in 3D (als Atome oder molekulare Oberfläche) angezeigt und der Benutzer kann seine Oberflächeneigenschaften, das molekulare lipophile Potential und das elektrostatische Potential berechnen und visualisieren.Für Proteinbewegungen berechnet BioBlender mithilfe der Blender Game Engine Zwischenprodukte zwischen zwei Konformationen.Das Programm gibt als Ausgabe sowohl die Zwischen-PDB-Dateien als auch die gerenderten Bilder als Film aus.BioBlender ist eine Implementierung von Blender, einem Open-Source-, frei verbreiteten, plattformübergreifenden, interoperablen und unterstützten Programm für 3D-Animation, visuelle Effekte und Videospiele.Die Kombination aus 3D-Computergrafik, Game Engine und wissenschaftlichen Programmen macht BioBlender zu einem vollständigen Instrument, um die Bewegung von Proteinen zu untersuchen und ihre Oberflächenmerkmale mithilfe eines visuellen Codes anzuzeigen, der auf Textur- und Partikel-Spezialeffekten basiert.Auf diese Weise können die physikalischen und chemischen Eigenschaften eines in Bewegung befindlichen Moleküls dargestellt werden.BioBlender ist das Ergebnis einer Zusammenarbeit von Wissenschaftlern verschiedener Disziplinen (Biologie, Chemie, Physik, Informatik) an der CNR in Pisa (Italien), die von der SciVis-Gruppe vorangetrieben wurde