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Cytoscape ist eine Open-Source-Softwareplattform zur Visualisierung komplexer Netzwerke und deren Integration in jede Art von Attributdaten.Viele Plugins sind für verschiedene Problembereiche verfügbar, darunter Bioinformatik, Analyse sozialer Netzwerke und Semantic Web.Cytoscape unterstützt viele Anwendungsfälle in den Bereichen Molekular- und Systembiologie, Genomik und Proteomik: Laden molekularer und genetischer Interaktionsdatensätze in vielen Formaten Projizieren und integrieren Sie globale Datensätze und funktionale Annotationenund analysieren von Menschen kuratierte Pathway-Datensätze wie Reactome oder KEGG.
Webseite:
http://www.cytoscape.org/Eigenschaften
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Alternativen zu Cytoscape für Mac mit kommerzieller Lizenz
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KeyLines Graph Visualization Toolkit
KeyLines ist ein JavaScript-Toolkit zum schnellen Erstellen leistungsstarker Grafikanwendungen.