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DNAssist
DNAssist bietet eine intuitive, einzelne Oberfläche, in der Sequenzdateien angezeigt, bearbeitet und analysiert werden.Der Benutzer kann die Anzeige in Editor-Fenstern anpassen, indem er Schriftart, Schriftgröße und Zeilenlänge auswählt.Eine Sequenz wird analysiert, indem einfach ein Editorfenster nach oben gebracht und die gewünschte Analyse aus dem Menü ausgewählt wird.Alle Analysen können auch in einem ausgewählten Bereich der Sequenz in einem Editorfenster durchgeführt werden.Wenn Sie mit der rechten Maustaste klicken, wird ein kontextsensitives Popup-Menü angezeigt.Dies gibt dem Benutzer eine bequeme Verknüpfung zu den meisten Menüelementen.Die auf DNAssist verfügbaren Analysen umfassen: Die Umwandlung einer DNA-Sequenz zwischen der kreisförmigen und der linearen Form. Die Umwandlung von DNA in eine RNA oder eine Proteinsequenz. Die Umwandlung von RNA in eine DNA oder eine Proteinsequenzin einem, drei oder allen sechs Frames Auffinden offener Leserahmen (ORFs) in einer DNA-Sequenz Auffinden bestimmter Sequenzmuster in einer Sequenz (dies ermöglicht Platzhalter, Fehlpaarungen und Lücken) Durchführen einer Restriktionsenzymanalyse mit einem definierten Satz von Enzymen Durchführen eines DNA-PromotorsAnalyse mit festgelegten Transkriptionsfaktoren Lokalisieren starker Nukleosomen-Positionierungssignale in der DNA Durchführen mehrerer Alignments von DNA, RNA oder Proteinen Ermitteln des Molekulargewichts einer Nukleinsäure oder eines Proteins Ermitteln der Schmelztemperatur eines Oligonukleotids Berechnen des pI eines Proteins Berechnen des hydrophilen, hydrophoben oderAntigenprofil eines Proteins Ermitteln des molaren Absorptionskoeffizienten und E0,1% eines Nukleinsäuresd oder ein Protein Durch das Erhalten der Nukleotid- oder Aminosäurezusammensetzung eines Nukleinsäure- oder Protein-DNAssists werden alle diese Funktionen in einer eng integrierten Windows-Anwendung zusammengefasst.Das Ergebnis einer Analyse wird in einem Ergebnisfenster angezeigt und kann gedruckt, auf Festplatte gespeichert oder kopiert und in Anwendungen von Drittanbietern eingefügt werden.Gespeicherte oder kopierte Ergebnisse behalten das Format bei, in dem sie angezeigt wurden.